Dos auditorías internas de la Contraloría General de la República al Ministerio de Agricultura, realizadas entre septiembre de 2020 y diciembre de 2024 durante la gestión del entonces ministro Limber Cruz, identificaron 56 inobservancias a la Ley 10-07 del Sistema Nacional de Control Interno, según los informes a los que tuvo acceso Diario Libre. Los hallazgos apuntan a pagos y contrataciones sin soporte documental, deudas vencidas con proveedores y financiamientos de vehículos otorgados a empleados sin la aplicación de los descuentos correspondientes en sus nóminas.

Uno de los puntos centrales del informe involucra los pagos ejecutados por la institución en 2024, que ascendieron a 7,514.5 millones de pesos. Sin embargo, el sistema Citrix, que la Contraloría utiliza para conectar a las entidades públicas con el Sistema Unificado de Gestión de Pagos, solo registró 4,339.5 millones de pesos, dejando un monto de 3,174.9 millones de pesos pagados que la Contraloría calificó como no debidamente soportado ni explicado por la institución. El órgano de control advirtió que esta situación genera riesgo de información financiera poco confiable y de pagos no conciliados o duplicados. Ya al cierre de 2023 se habían identificado 57 desembolsos por 96 millones de pesos sin cotizaciones, facturas ni actas de adjudicación, junto a otros 219.8 millones pagados a terceros sin revisión de auditoría interna.

En materia de contrataciones, de una muestra de 77 expedientes de un total de 380 procesos de compras ejecutados en 2024 por 978.3 millones de pesos, la Contraloría encontró que el 92.8 % carecía de la documentación necesaria para evidenciar el cumplimiento de los procedimientos establecidos, lo que representa, según el informe, un riesgo alto de incumplimiento normativo, financiero, reputacional e institucional.

El Ministerio también arrastraba, para 2024, cuentas por pagar de 609.8 millones de pesos, parte de ellas con antigüedad de entre 120 y 365 días, además de haber otorgado 100.6 millones de pesos en préstamos para vehículos a empleados sin que se verificara el descuento correspondiente en las nóminas revisadas.

A nivel presupuestario, entre 2020 y 2023 la institución dejó de ejecutar 3,999 millones de pesos de una asignación de 97,249 millones, y en 2024 subutilizó 265.8 millones de pesos adicionales. La Contraloría también detectó que la información publicada en el portal de transparencia de Agricultura no coincidía con el presupuesto real recibido: al cierre de 2023, el monto oficial era de 100,145.2 millones de pesos, mientras el portal institucional reportaba 91,128.5 millones, una diferencia de 9,016.6 millones de pesos.

Otro hallazgo señala que, entre septiembre y diciembre de 2023, la institución transfirió 1,247.5 millones de pesos de ingresos extrapresupuestarios directamente a fondos internos, y solo depositó 6.4 millones en la Cuenta Única del Tesoro, pese a que la normativa exige que todo ingreso de este tipo sea trasladado a esa cuenta dentro de las 24 horas siguientes a su generación. Diario Libre intentó contactar a Limber Cruz para conocer su posición sobre estos hallazgos, pero no obtuvo respuesta al cierre de esa entrega informativa.